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靶向代謝組
?靶向代謝組學概述
靶向代謝組學(Targeted metabolomics):針對幾種目標化合物或某條通路上涉及的全部或部分代謝物,利用標準品,構建特異性強、靈敏度高、重復性好的檢測方法,對目標化合物進行定量與分析。
我們可同時對中心碳代謝的多個通路中共220種代謝物進行靶向檢測,還可針對膽汁酸代謝、氨基酸代謝、內源性大麻素類、神經遞質類、維生素類、卡尼汀類、植物次生代謝產物以及短鏈脂肪酸類等進行靶向檢測。
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?靶向代謝組學實驗流程
基于 LC-MS/GC-MS 技術,采用目標化合物標準品進行方法優化、方法驗證、生物樣本收集、代謝物提取、質譜檢測、數據分析等。
?靶向代謝化合物檢測列表
?應用方向
短鏈脂肪酸
具有調節血糖、抗炎、改善腸道功能的作用。
氨基酸
與人的心血管疾病、糖尿病相關與植物的生長發育、抗逆、衰老過程相關。
脂肪酸
是細胞膜主要成分,具有抑菌、調節腸道菌群結構等功能,與多種疾病相關。
中心碳相關物質
動植物生命活動的物質基礎,與動植物的成長發育過程密切相關。
TMAO及其他相關物質
存在于水產、哺乳動物、植物、真菌中,與心血管疾病、心肌梗死、糖尿病相關。
神經遞質
充當“信使”的特定化學物質,與多種神經系統病相關。
膽汁酸
存在于人和動物膽汁、糞便、血液中,與肝膽疾病(肝炎、肝硬化)、腸胃疾病(胃潰瘍)相關。
?可分析樣本類型
植物組織、動物組織、血清、血漿、尿液、細胞、微生物、糞便、唾液、腦嵴液、發酵液、橄欖油、胃液、其他
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非靶向代謝組檢測
?非靶向代謝組學概述
非靶向代謝組學(Untargeted metabolomics)是指采用 LC-MS、GC-MS、NMR技術,無偏向性的檢測細胞、組織、器官或?者生物體內受到刺激或擾動前后所有小分子代謝物(主要是相對分子量1000 Da以內的內源性小分子化合物)?的動態變化,并通過生信分析篩選差異代謝物,對差異代謝物進行通路分析,揭示其變化的生理機制。
?方法流程
代謝組學研究實驗流程可分為樣本采集及前處理、代謝物提取及濃縮、?上機檢測以及數據分析,進而揭示其生命機制。美序生物對每一個實驗步驟都嚴格把控,?實現標準化操作,從根本上確保高質量數據的產出。
?美序生物的優勢
?應用領域
?分析類型
腸道菌群代謝全譜分析
植物代謝組學分析
膽汁酸全譜分析
醫學代謝組學分析
藥物代謝組學
細胞代謝組學分析
微生物代謝組學分析
?樣本要求
樣本類型及需求量:
血清、血漿 ≥ 0.25ml、血清、血漿 ≥ 0.25ml、尿液 ≥ 0.25ml、糞便 ≥ 0.5g、動物組織 ≥ 0.5g、植物組織 ≥ 1g、細胞 ≥ 107個、微生物 ≥ 0.25g。
生物學重復:臨床樣本 n ≥ 30、動物樣本 n ≥ 8、植物和微生物樣本 n ≥ 6。
脂質組學
?脂質組學概念
脂質是一類疏水性或兩性小分子。脂質組學(Lipidomics)是一種基于高通量分析技術,系統性解析生物體脂質組成與表達變化的研究模式。脂質組學分析,可以高效地研究脂類家族、脂質分子在各種生物過程中的改變與功能,進而闡明相關的生物活動機制與原理。
?脂質大體分為八大類:
1.脂肪酸類(fatty acids)
2.甘油脂類(glycerolipids)
3.甘油磷脂類(glycerophospholipids)
4.鞘脂類 (sphingolipids)
5.固醇脂類(sterol lipids)
6.孕烯醇酮脂類(prenol lipids)
7.糖脂類(saccharolipids)
8.多聚乙烯類(polyketides)
?脂質組學應用及美序優勢
脂質結構的多樣性賦予了脂質多種重要的生物功能,脂質分子是生物膜的必需組分,另外脂質還是生物體血液中含量最高的組分,作為生物體能量平衡的重要組成部分,脂質自身也是重要的信號分子,廣泛地參與細胞間、細胞內的信號轉導。脂質異常代謝也是引發人類健康的心腦血管疾病、惡性腫瘤、神經體系疾病和代謝紊亂疾病等的重要因素。
我公司采用高通量測試分析平臺一次定性脂質1000種左右,并且利用先進的生物信息分析軟件對這些脂質分子功能進行深入分析,為闡明脂質小分子的功能提供科學指導。同時我公司基于自身儀器平臺開發了標準品數據庫內含標準品500余種,同時公司還具備化學合成部,對于市面上買不到的標準品進行合成,為標志物的定性提供強有力的標準品支持。